J. Domingo Esteve, O. Kutsyr Kolesnyk, M. T. León Mendoza, R. Raúl Pérez Moraga, G. Ayala Gallego, B. Rosón Burgo
La secuenciación del ARN de célula única (scRNA-seq) es una poderosa herramienta para investigar los cambios en la abundancia celular durante los procesos de regeneración y remodelación de los tejidos. Su fiabilidad depende de la adecuada identificación de las poblaciones de células de los datos que, a su vez, depende del procedimiento de agrupamiento que se utilice. El método de Particionamiento alrededor de Medoides (PAM) es bien conocido y una de sus ventajas es que facilita la interpretación posterior de los grupos identificando individuos reales del conjunto de datos como sus centros (medoides), sin embargo su aplicación a problemas de clasificación de células está limitada por su alto costo computacional y requisitos de memoria. Nuestro estudio explora la idoneidad del PAM para analizar la dinámica de remodelación endometrial a lo largo del ciclo menstrual y proporciona información sobre los cambios en las poblaciones de células endometriales.
Palabras clave: Single Cell RNASeq, Partitioning Around Medoids, Differential Abundance, Human endometrial cell types
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GT17.SDDS2 Sesión Invitada
8 de noviembre de 2023 10:10
CC3: Sala 1